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PFEM
Ingénieur d'étude : Analyste en spectrométrie de masse

Mon activité principale, sur la plateforme de spectrométrie de masse (PFEM) consiste à l’identification de métabolites, marqueurs de consommation ou de pathologies principalement dans le domaine de la nutrition humaine. L’objectif est de partir de l masse moléculaire d’un ion considérer comme « VIP » de déterminer à minima sa formule brute mais surtout d’obtenir la formule développée et donc le nom chimique de cette molécule. Pour cela, j’ai à ma disposition différents outils et/ ou strategies: (1) – Au niveau analytique, j’utilise un appareil de spectrométrie de masse de haute résolution de type Orbitrap couplé à de la chromatographie liquide ultra Haute performance. Grace à cet appareil dont la résolution peut aller jusqu’à 500000, j’obtiens des profils analytiques des différents composés que je dois identifier. Je suis également amené  à utiliser des techniques d’échanges deutérées pour m’aider dans l’interprétation des spectres (2) – Des outils plus informatiques et bases de données qui me permettent d’obtenir seulement la masse précise des composés, mais également celles de leurs fragments qui me permettront de remonter à la formule développée et donc au nom du composé.

Mes 5 publications scientifiques les plus marquantes :

- Max Piffoux (1) , Jérémie Jacquemin (2) , Mélanie Pétéra (3) , Stephanie Durand (3) , Angélique Abila (3) , Delphine Centeno (3) , Charlotte Joly (3) , Bernard Lyan (3) , Anne-Laure Martin (4) , Sibille Everhard (4) , Sandrine Boyault (2) , Barbara Pistilli (5) , Marion Fournier (6) , Philippe Rouanet (7) , Julie Havas (5) , Baptiste Sauterey (8) , Mario Campone (8) , Carole Tarpin (9) , Marie-Ange Mouret-Reynier (10) , Olivier Rigal (11) , Thierry Petit (12) , ChristinLasset (2) , Aurélie Bertaut (13) , Paul Cottu (14) , Fabrice Andre (5) , Ines Vaz-Luis (5) , Estelle Pujos-Guillot (3) , Youenn Drouet (2) , Olivier Trédan (2) Metabolomic prediction of breast cancer treatment induced neurological and metabolic toxicities Clinical Cancer Research  - 2024

- Damont A, Olivier MF, Warnet A, Lyan B, Pujos-Guillot E, Jamin EL, Debrauwer L, Bernillon S, Junot C, Tabet JC, Fenaille F. Proposal for a chemically consistent way to annotate ions arising from the analysis of reference compounds under ESI conditions: A prerequisite to proper mass spectral database constitution in metabolomics. Journal of Mass Spectrometry 2019; 54(6): 567-82.

- Martin, J.-C. ,Maillot, M., Mazerolles, G., Verdu, A., Lyan, B., Migné, C., Defoort, C., Canlet, C., Junot, C., Guillou, C., Manach, C., Jacob, D., Jouan Rimbaud Bouveresse, D., Paris, E., Pujos-Guillot, E., Jourdan, F., Giacomoni, F., Courant, F., Fave, G., Le Gall, G., Chassaigne, H., Tabet, J.-C., Martin, J.-F., Antignac, J.-P., Shintu, L., Defernez, M., Philo, M., Alexandre Gouaubau, M.-C., Amiot, M. J., Bossis, M., Triba, M., Stojilkovic, N., Banzet, N., Molinié, R. ., Bott, R., Goulitquer, S., Caldarelli, S., Rutledge, D. Can we trust untargeted metabolomics: results of the metabo-ring Initiative, a large-scale multi-instruments inter-laboratoire study. Metabolomics, 11 (4), 807-821 (2015).

- Pujos-Guillot, E, Hubert, J., Martin, J.-F., Lyan, B., Quintana, M., Claude, S., Chabanas, B., Rothwell, J., Bennetau-Pelissero, C., Scalbert, A., Comte, B., Hercberg, S., Morand, C., Galan, P., Manach, C. (2013). Mass Spectrometry-based Metabolomics for the Discovery of Biomarkers of Fruit and Vegetable Intake: Citrus Fruit as a Case Study., J Proteome Res 12 (4), 1645-1659  2013

- Bernard Lyan (1) , Véronique Azaïs-Braesco (2) , Nicolas Cardinault , Viviane Tyssandier (2) , Patrick Borel (2) , Marie Cécile Alexandre-Gouabau (2) , Pascal Grolier (2) Simple method for clinical determination of 13 carotenoids in human plasma using an isocratic high-performance liquid chromatographic method

 

PlateForme d'Exploration du Métabolisme (PFEM)