PlateForme d'Exploration du Métabolisme (PFEM)

Je travaille sur la plateforme d'exploration du métabolisme, où je mène des analyses chimiques par spectrométrie de masse dans le cadre de projets de recherche en nutrition humaine.

Mon rôle inclut des échanges avec les chercheurs pour bien comprendre leurs besoins et proposer les méthodes d'analyse adaptées. J'assure la préparation des échantillons, réalise les analyses, traite les données et présente les résultats aux porteurs de projets. Pour garantir la fiabilité des résultats, je contrôle régulièrement les appareils d'analyse afin d'intervenir en cas de dérive ou de dysfonctionnement. J’encadre et je forme également des étudiants de licence professionnelle dans le cadre de leur stage de fin d’étude ou en apprentissage.

Je suis également membre du collectif international Workflow4Metabolomics (W4M) et notamment formatrice en traitement des données métabolomiques par l’outil W4M disponible sur la plateforme Galaxy.

Mes 5 publications favorites : 

• Metabolomic prediction of breast cancer treatment induced neurological and metabolic toxicities, Max Piffoux,Jérémie Jacquemin,Mélanie Pétéra,Stephanie Durand,Angélique Abila,Delphine Centeno,Charlotte Joly,and All, Clinical Cancer Research 2024. DOI : 10.1158/1078-0432.CCR-24-0195
• PeakForest: a multi-platform digital infrastructure for interoperable metabolite spectral data and metadata management, Nils Paulhe, Cécile Canlet, Annelaure Damont, Lindsay Peyriga, Stéphanie Durand, Catherine Deborde, Sandra Alves, Stephane Bernillon,  Thierry Berton, Raphael Bir, Alyssa Bouville, Edern Cahoreau, Delphine Centeno, Robin Costantino, Laurent Debrauwer, Alexis Delabrière, Christophe Duperier, Sylvain Emery, Amelie Flandin, Ulli Hohenester, Daniel Jacob, Charlotte Joly and All, Metabolomics, 2022.  DOI : 10.1007/s11306-022-01899-3
• ProMetIS, deep phenotyping of mouse models by combined proteomics and metabolomics analysis, Alyssa Imbert, Magali Rompais, Mohammed Selloum, Florence Castelli, Emmanuelle Mouton-Barbosa, Marion Brandolini-Bunlon, Emeline Chu-Van, Charlotte Joly, Aurélie Hirschler, Pierrick Roger-Mele, Thomas Burger, Sophie Leblanc, Tania Sorg, Sadia Ouzia, Yves Vandenbrouck, Claudine Médigue, Christophe Junot, Myriam Ferro, Christine Carapito, Anne Gonzalez de Peredo ,François Fenaille, Christine Carapito, Yann Herault, Etienne A. Thévenot, Scientific Data, 2021. DOI : 10.1038/s41597-021-01095-3
• Multiplatform metabolomics for an integrative exploration of metabolic syndrome in older men, Blandine Comte, Stéphanie Monnerie, Marion Brandolini-Bunlon, Cécile Canlet, Florence Castelli, Emeline Chu-Van, Benoit Colsch, François Fenaille, Charlotte Joly, Fabien Jourdan, Natacha Lenuzza, Bernard Lyan, Jean-François Martin, Carole Migné, José Morais, Mélanie Pétéra, Nathalie Poupin, Florence Vinson, Etienne Thevenot, Christophe Junot, Pierrette Gaudreau, Estelle Pujos-Guillot, EBioMedicine, 2021. DOI : 10.1016/j.ebiom.2021.103440
• Assessment of protein modifications in liver of rats under chronic treatment with paracetamol (acetaminophen) using two complementary mass spectrometry-based metabolomic approaches, Carole Mast, Bernard Lyan, Charlotte Joly, Delphine Centeno, Franck Giacomoni, Jean-Francois Martin, Laurent Mosoni, Dominique Dardevet, Estelle Pujos-Guillot, Isabelle Papet, Journal of Proteomics, 2015.  DOI : 10.1016/j.jprot.2015.03.014

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